سازمان آموزشی، علمی و فرهنگی کشورهای اسلامی (آيسسکو) در سال 1982 تاسيس شد. هدف از تشکيل اين سازمان ايجاد همبستگی بين امت اسلامی از راه آموزش، علوم و فرهنگ، گسترش علم و فن‏آوری در کشورهای اسلامی، برقراری همکاری بين نخبگان مسلمان، حمايت از اقليت‏های مسلمان در کشورهای غربی و غير مسلمان، و به‏طور کلی برقراری همکاری و داد و ستد علمی، آموزشی و فرهنگی بين مسلمانان در سراسر جهان بود. هم‏اکنون پنجاه کشور اسلامی عضو اين سازمانند. مقر دائمی سازمان در شهر رباط (مراکش) قرار دارد و زبان‏های کاری آن، عربی، انگليسی و فرانسه است.

ساختار سازمانی آيسسکو شامل سه رکن مجمع عمومی، شورای اجرايی و اداره‏کل است. رياست سازمان نيز بر عهده مديرکل آن است. اين سمت از سال 1991 تا کنون بر عهده دکتر عبدالعزيز عثمان‏التويجری بوده است.

مجمع عمومی آيسسکو از نمايندگان کشورهای عضو تشکيل شده و هر سه‏سال يک‏بار تشکيل جلسه می‏دهد. شورای اجرايی نيز که اعضای آن، نمايندگان کشورهای عضو هستند هر سه‏سال يک‏بار تشکيل جلسه می‏دهد.

جمهوری اسلامی ايران از سال 1371 به عضويت آيسسکو درآمده و هم‏اکنون يکی از اعضای فعال و تاثيرگذار آن به‏شمار می‏رود.

کميسيون ملی آيسسکو در جمهوری اسلامی ايران جزو نهادهای مستقر در وزارت آموزش و پرورش است و وزير آموزش و پرورش، رئيس شورای عالی کميسيون ملی به‏شمار می‏رود.

اين کميسيون از سال 1383 بر اساس مصوبه هیات محترم دولت در دفتر همکار‏های علمی بين‏المللی مستقر شد و مديرکل دفتر، دبيرکل کميسيون ملی آيسسکو نيز می‏باشد.